二甲双胍的不良反应包括：
常见的有轻度消化道不适。
包括食欲不振、恶心、胃痛、胃部饱胀感和腹泻。这些反应多出现在用药初期，经过身体适应后可以自行缓解，一般一至两周后消失。如果严重，可以调整剂量或改用肠溶制剂。
如果腹泻超出一周可以考虑停药，可能是药物作用于肠道菌群的诱发的急性反应。乳酸酸中毒
发生率极低，主要与肾功能不全有关。肾功能正常患者几乎不会出现。一些慢性心或肝肾功能不全的病人如果乳酸水平较高，可能会加重乳酸中毒。维生素B12缺乏
长期使用可能影响B12的吸收，需要定期监测血液学指标。动态心电图变化
极少数患者可出现心律失常，需要定期监测心电图。皮肤反应
偶见皮疹、瘙痒等过敏反应。乳腺增生
女性偶有乳房肿胀不适，停药后可自行消退。肝功能异常
少数患者ALT升高，可考虑与控制不良的糖尿病相关。低血糖
极少数患者在与胰岛素等药物联合应用时可出现低血糖，需要监测血糖。
除以上副作用外，二甲双胍对肝肾功能无直接影响，也不会增加低血糖发生率。在医生监护下正确用药，二甲双胍整体上是一种长期安全的药物。
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